La organización desarrolla múltiples iniciativas, entre ellas: visibilización y educación a través de programas y conferencias; investigación, análisis, denuncias e informes; formulación de estrategias políticas para avanzar agendas de paz y derechos humanos; organización de delegaciones en América Latina, el Caribe y Estados Unidos; así como apoyo técnico y político a víctimas de violaciones de derechos humanos.

El presidente de CAP, Raudemar Ofunshi Hernández, lidera la organización con más de tres décadas de experiencia en movimientos sociales, luchas ambientales y defensa de los derechos humanos. La organización cuenta con una Junta Consultiva conformada por cuatro personas que actúan como consejeros estratégicos.

Colombia Acuerdo de Paz ha realizado un trabajo extenso en el sistema de las Naciones Unidas, la Organización de Estados Americanos, los Congresos de Estados Unidos y de varios países de la región. Además, mantiene alianzas con un amplio número de organizaciones, expertos, académicos, periodistas, agrupaciones de víctimas y veteranos.